3万美军驻台

1943年上海，军统特工陈浅奉命对日本人进行暗杀，却掉入日本梅机关特务头子井田裕次郎的陷阱，陈浅置之死地，幸得潜伏在梅机关的共产党员“飞天”相救，逃出生天，并意外得知了日本人的阴谋。为了阻止侵略者的险恶计划，陈浅开始接受特训，伪装成日本特使再度光临梅机关。深入敌营的陈浅在黑暗中步步为营，如履薄冰，在共产党员春羊的帮助下屡次化险为夷，当几位共产党人牺牲后，陈浅受到强烈的震撼，逐渐坚定了自己的共产主义信仰。之后，他与共产党地下组织通力合作，成功粉碎日寇阴谋。日军战败后，陈浅以秘密共产党员的身份重回军统，与共产党新一任“飞天”携手合作，生死与共，挫败了军统的“涅槃计划”，迎来重庆和平解放。。真壁一骑是个生长在对日本而言十分乡下的龙宫岛上的少年──对他来说，像这样的和平是普通到不能在普通的状况。 但当由硅所构成的不明生物·异界体（Festum）开始攻击龙宫岛时，他才开始注意到他现在所拥有的和平生活不过只是个被创造出来的假象。 为了取回自己的和平生活，他和同伴开始一起搭乘人类所创造出来的巨大兵器·法夫那（Fafner）和异界体战斗── 在激战的彼端，等待着他的是……。